MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 plasmid pSFxv_4

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017321	TGAG	2	8	64	71	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017321	CGC	2	6	83	88	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_017321	AGCG	2	8	340	347	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017321	CAG	2	6	437	442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017321	GCG	2	6	650	655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017321	CCG	2	6	708	713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_017321	GCC	2	6	729	734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_017321	GGT	2	6	806	811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017321	TGT	2	6	2466	2471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017321	T	6	6	2490	2495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017321	TGGT	2	8	2503	2510	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017321	TCAG	2	8	2533	2540	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017321	GT	3	6	2592	2597	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017321	TCT	2	6	2676	2681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017321	CTGG	2	8	2722	2729	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017321	GGT	2	6	2809	2814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017321	TTG	2	6	2815	2820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017321	CTG	2	6	2835	2840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017321	CAA	2	6	3378	3383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017321	CCA	2	6	3601	3606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_017321	GCT	2	6	3654	3659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017321	G	6	6	3740	3745	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017321	CA	3	6	3752	3757	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017321	G	6	6	3987	3992	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017321	CTT	2	6	4025	4030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.